O Colégio de Diretores é integrado pelos directores das unidades orgânicas da NOVA e presidido pelo Reitor. O Colégio pode integrar outros membros ligados à NOVA, designados por tempo determinado, por iniciativa do Reitor e da maioria dos diretores.
Fernando José Pires Santana, Faculdade de Ciências e Tecnologia
João de Deus Santos Sàágua, Faculdade de Ciências Sociais e Humanas
José António Ferreira Machado, Nova School of Business and Economics
José Miguel Barros Caldas de Almeida, Faculdade de Ciências Médicas
Teresa Pizarro Beleza, Faculdade de Direito
Paulo de Lyz Girou Martins Ferrinho, Instituto de Higiene e Medicina Tropical
Pedro Miguel Pereira Simões Coelho, Instituto Superior de Estatística e Gestão de Informação
Luis Paulo Rebelo, Instituto de Tecnologia Química e Biológica
João António Catita Garcia Pereira, Escola Nacional de Saúde Pública