Cláudio M. Soares licenciou-se em Bioquímica, em 1989, pela Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal. Realizou o seu projeto de doutoramento na Universidade de Uppsala, Suécia (que apresentou na Universidade de Lisboa em 1994).
Ingressou no ITQB NOVA em 1994 e dirige nesta instituição, desde 1999, o Laboratório de Modelação de Proteínas, um dos primeiros laboratórios em Portugal na área. O Laboratório trabalha em modelação molecular de proteínas usando métodos biofísicos computacionais e os seus membros têm experiência num grande número de áreas, desde a investigação fundamental em métodos, a aplicações com interesse biotecnológico e biomédico.
É Professor Catedrático no ITQB NOVA e foi Diretor do instituto entre 2013 e 2023, e Subdiretor de 2005-2008 e 2011-2013.
É autor de 128 artigos publicados ou aceites em revistas científicas com revisão por pares e tem um h-index de 41 (SCOPUS). É 1º Secretário da Assembleia Geral da Sociedade Portuguesa de Biofísica e Presidente do Conselho Científico do TAGUSPARK - Parque de Ciência e Tecnologia, Portugal. Foi Presidente da Sociedade Portuguesa de Biofísica (2002-2008), membro do Comité de Cursos Avançados da Federation of European Biochemical Societies (FEBS) (2015-2018) e membro do Conselho da International Union for Pure and Applied Biophysics (IUPAB) (2011-2017). Desde 2004, tem sido avaliador de várias agências de financiamento internacionais, incluindo a Comissão Europeia. Até à data orientou as teses de 5 estudantes de licenciatura, 5 estudantes de mestrado e 15 estudantes de doutoramento (10 destes já concluíram o grau). Supervisionou também o trabalho científico de 14 estudantes de investigação e de 10 pós-docs.
Desde 1996, participou em 36 projetos de investigação com financiamento competitivo, sendo atualmente o Coordenador de um grande projeto financiado pela La Caixa Foundation, que abarca um consórcio de 7 Laboratórios em Portugal e Espanha. É também, desde 2015, o Coordenador da Unidade de Investigação Molecular, Structural and Cellular Microbiology – MOSTMICRO-ITQB do ITQB NOVA, avaliada como Excelente pela Fundação para a Ciência e Tecnologia, I.P.
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