O Conselho de Estudantes é o órgão consultivo da NOVA nas matérias que digam diretamente respeito à vida dos estudantes. O Conselho de Estudantes é integrado pelo Reitor, que preside, por um Vice -Reitor ou um Pró -Reitor designado pelo Reitor, pelos presidentes das associações de estudantes das unidades orgânicas da NOVA, pelo Administrador da Universidade e pelo Administrador Executivo dos SASNOVA.