O Conselho de Disciplina é o órgão consultivo da NOVA em matéria disciplinar. É composto por três docentes ou investigadores, escolhidos pelo Reitor; um funcionário não docente, nomeado pelo Administrador da NOVA; e um estudante, designado pelo Conselho de Estudantes.
O Conselho de Disciplina da Universidade Nova de Lisboa é composto por: